생물학 - Bioinformatics Sequencing 보고서

Bioinformatics Sequencing

1. 실험 제목
Bioinformatics Sequencing

2. 실험목적
sequencing에 대해 이해하고, sequencing을 통해 알 수 있는 DNA 염기서열을 가지고 BLAST 분석을 통하여 gene의 ORF, homology, restriction enzyme site, motif, 2D structure 등을 알아보고 한다.

3. 실험 방법
① 실험 수업 시간에 실험 조교가 Nucleotide blast, Protein blast, Homolog 찾기, Restriction Enzyme site search의 시범을 보여주었다.
② 핸드아웃과 함께 첨부된 20개의 DNA sequence를 가지고 수강생들은 실험시간 후에 각자 nucleotide blast를 하여 어떤 유전자인지 결과를 분석하였다.
③ 해당 유전자가 생성하는 단백질을 protein blast로 찾았다. Protein이 가진 conserved domain을 찾아서 구조를 확인하였다.
④ 사람과 쥐의 protein sequence를 비교하였다.
⑤ DNA sequence의 Restriction Enzyme site를 찾아보았다.

4. 실험 재료
BLAST한 sequence : 3번
aattgcttaa aagatatgtt gcaaacatag caagaggcgg cagtataaga tttttcttca
gaagatgaat ataattgaat aagttggtta taatggtaag ggtagccgat tgtactgtgg
ggcattatgc ccctattttt tatttataaa tatgaaaaaa ggttgcacaa accaggatga
taatgtaaaa taataaaagg aggcgatatg atgagtagga aacttattaa atatttacct
ttactagtgc tggcatccag tgttttaagc ggatgttcca acaatgtgtc aagtatcaaa
....

[hwp/pdf]생물학 - Bioinformatics Sequencing 보고서